淺析大鼠CRH基因干擾慢病毒載體的構(gòu)建論文
促腎上腺皮質(zhì)激素釋放激素(CRH)由下丘腦室旁核(PVN)合成,促進(jìn)腺垂體合成與釋放促腎上腺皮質(zhì)激素(ACTH)。CRH 作為應(yīng)激反應(yīng)的中樞起始調(diào)節(jié)因子之一,在應(yīng)激時(shí)含量明顯增高。Plotsky等觀察到大鼠新生期母嬰分離引起的應(yīng)激模型中PVN內(nèi)CRH mRNA及CRH 受體1(CRH-R1)表達(dá)明顯增多。RNA干擾(RNAi)是一種通過降解靶基因mRNA使靶基因表達(dá)減少或沉默的技術(shù),再結(jié)合慢病毒載體技術(shù)就實(shí)現(xiàn)了長(zhǎng)期、穩(wěn)定的基因沉默效應(yīng)。本實(shí)驗(yàn)旨在篩選CRH 基因的RNAi有效靶點(diǎn),構(gòu)建和鑒定CRH 基因RNAi的慢病毒載體,為后期研究CRH 神經(jīng)元敏感化在應(yīng)激反應(yīng)中的作用及機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
材料與方法
一、材料
包裝細(xì)胞293T細(xì)胞株(吉?jiǎng)P基因公司);大腸桿菌菌株DH5α、DMEM 培養(yǎng)基、胎牛血清、胰蛋白酶、Lipofectamine 2000(Invitrogen 公司);pEGFP-N1-3FLAG Vector(BD 公司);EcoRⅠ/BamHⅠ內(nèi)切酶(上海吉?jiǎng)P基因化學(xué)技術(shù)有限公司);限制性內(nèi)切酶、T4DNA連接酶(NEB公司);質(zhì)粒DNA提取試劑盒、凝膠回收試劑盒、DNA 純化試劑盒(Qiagen公司);Mouse Anti-flag(1∶3000)(Sigma公司)。
二、方法
1.CRH 基因過表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
載體GV143質(zhì)粒XhoⅠ/KpnⅠ酶切后,化學(xué)合成目的基因。用XhoⅠ/KpnⅠ酶切化學(xué)合成的含有目的基因的質(zhì)粒,酶切產(chǎn)物電泳回收后進(jìn)行定向連接,其產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α大腸桿菌。選擇單克隆進(jìn)行菌落PCR鑒定,再對(duì)PCR鑒定陽性的克隆進(jìn)行測(cè)序(上海吉?jiǎng)P基因化學(xué)技術(shù)有限公司),比對(duì)正確的克隆即為構(gòu)建成功的過表達(dá)質(zhì)粒。用于菌落PCR鑒定轉(zhuǎn)化子的引物為:(1)CMV-F:5′-CGCAAATGGGCGGTAGGCGTG-3′;(2)EGFP-N-R:5′-CTGGTCGAGCTGGACGGCGACG-3′。
2.RNAi病毒載體質(zhì)粒構(gòu)建
針對(duì)CRH mRNA(NM_031019),設(shè)計(jì)并合成4對(duì)針對(duì)CRH基因的小干擾RNA(siRNA)的核苷酸序列,同時(shí)設(shè)計(jì)并合成一段無意義序列作為陰性對(duì)照。挑取陽性克隆送至上海吉?jiǎng)P基因化學(xué)技術(shù)有限公司測(cè)序鑒定,構(gòu)建的4種干擾質(zhì)粒分別命名為KD1、KD2、KD3和KD4。該RNAi病毒載體可同時(shí)表達(dá)綠色熒光蛋白(GFP),用于判斷轉(zhuǎn)染效率。根據(jù)Invitrogen公司的Lipofectamine 2000使用說明共轉(zhuǎn)染培養(yǎng)好的工具細(xì)胞293T細(xì)胞。
3.CRH基因RNAi有效靶序列篩選
分為三組:NC組共轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒和陰性對(duì)照病毒載體質(zhì)粒作為陰性對(duì)照;CON 組為不轉(zhuǎn)染任何質(zhì)粒的293T細(xì)胞;KD組共轉(zhuǎn)染過表達(dá)質(zhì)粒和RNAi靶點(diǎn)病毒載體質(zhì)粒(分為KD1、KD2、KD3、KD4,分別含有針對(duì)目的基因的不同干擾靶點(diǎn)序列的RNAi病毒載體質(zhì)粒)。轉(zhuǎn)染后24h熒光顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)染效果,轉(zhuǎn)染后36h收集細(xì)胞抽提蛋白,使用抗GFP抗體Western blot法檢測(cè)目的基因的表達(dá)情況,進(jìn)而判斷不同靶點(diǎn)的干擾效果。
4.病毒包裝
293T 細(xì)胞培養(yǎng)至活細(xì)胞達(dá)70%-80%時(shí)轉(zhuǎn)染篩選出的干擾質(zhì)粒和DNA溶液。把稀釋后的干擾質(zhì)粒和DNA混合液與稀釋后的Lipofectamine 2000于5min內(nèi)混合,室溫溫育20min,于37℃細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。8h后倒去含有轉(zhuǎn)染混合物的培養(yǎng)基,每瓶細(xì)胞加入20ml的PBS液,棄洗液。每瓶細(xì)胞中加入含10%胎牛血清的細(xì)胞培養(yǎng)基25ml,培養(yǎng)箱內(nèi)繼續(xù)培養(yǎng)48h。收集轉(zhuǎn)染48h的293T細(xì)胞上清液,于4℃、4000 g離心10min,收集上清液;將上清液以0.45μm濾器過濾后置于40ml超速離心管中,4℃、4000 g 離心10-15min,將病毒濃縮液移出。
5.病毒生物學(xué)滴度測(cè)定
測(cè)定前1d在96孔板鋪板,每孔加4×104 個(gè)293T細(xì)胞,體積為100腳莀__M_μl。用系列稀釋的制備的病毒載體分別加入96孔培養(yǎng)板。24h后加入完全培養(yǎng)基100μl。4d后熒光顯微鏡觀察熒光表達(dá)情況。根據(jù)熒光圖片中GFP表達(dá)情況,計(jì)數(shù)最大稀釋倍數(shù)孔中的帶有熒光的細(xì)胞個(gè)數(shù),計(jì)算病毒滴度(TU/ml)=(熒光細(xì)胞個(gè)數(shù)×轉(zhuǎn)染時(shí)細(xì)胞數(shù)/100×每孔加入病毒稀釋液體積)×1/稀釋濃度。
結(jié)果
一、CRH 基因過表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
CRH 基因過表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建GV143載體進(jìn)行XhoⅠ/KpnⅠ酶切;瘜W(xué)合成目的.基因,用XhoⅠ/KpnⅠ酶切化學(xué)合成的含有目的基因的質(zhì)粒得到565bp的片段,將其連入酶切載體中。挑單克隆PCR得到845bp的特異性條帶。送200μl進(jìn)行測(cè)序,測(cè)序結(jié)果與目標(biāo)序列完全一致,表明CRH基因過表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建成功。將CRH 基因過表達(dá)質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,收集細(xì)胞總蛋白。通過Western blot檢測(cè)轉(zhuǎn)染293T的樣品,可以觀察到49kD附近處有特征條帶,其大小和目的基因融合蛋白相比大小相符(見內(nèi)頁4圖4)。轉(zhuǎn)染24h后,熒光顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)染效果。
二、CRH 基因RNAi有效靶序列篩選
重組克隆載體PCR鑒定、測(cè)序,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,連接入短發(fā)夾RNA(shRNA)的片段的陽性克隆PCR的片段大小為340bp;沒有連接入shRNA的片段的空載體克隆PCR片段大小為299bp。經(jīng)測(cè)序分析后確認(rèn)插入序列正確,說明GV143-CRH中已含有siRNA 模板DNA的片段。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳。轉(zhuǎn)染24h后,熒光顯微鏡下觀察轉(zhuǎn)染效果。從Western blot結(jié)果可以看出,KD2、KD3、KD4靶點(diǎn)對(duì)CRH 基因的表達(dá)有敲減作用,是有效靶點(diǎn)。我們選擇KD2靶點(diǎn)(siRNA 序列5′-TCAGGAAACTGATGGAGATTATCTCGAGATAATCTCCATCAGTTTCCTGTTTTTTC-3′)進(jìn)行CRH 基因RNAi慢病毒表達(dá)載體的構(gòu)建。
三、病毒包裝及生物學(xué)滴度測(cè)定
干擾質(zhì)粒和輔助質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞后在熒光顯微鏡下發(fā)出綠色熒光。病毒原液滴度為1.5×109 TU/ml,表明我們已成功構(gòu)建了高滴度的慢病毒載體,病毒成功包裝。
討論
1981年Vale從綿羊下丘腦中分離出調(diào)節(jié)ACTH釋放的肽,即CRH。CRH 不但在腦組織中分布廣泛,也可廣泛分布于中樞及外周神經(jīng)組織,中樞內(nèi)以下丘腦含量最高,主要分布于PVN的小細(xì)胞中,在其他神經(jīng)核團(tuán)中也分布有少量CRH。CRH 調(diào)節(jié)下丘腦-垂體-腎上腺軸(HPA軸),參與應(yīng)激反應(yīng)。CRH是通過CRH-R起作用的,CRH-R在腦的不同部位均有表達(dá),目前已知的CRH-R有CRH-R1、CRH-R2和CRH-R3三種亞型。Hsu等報(bào)道急性應(yīng)激可引起大鼠丘腦CRH mRNA水平增高,而重復(fù)應(yīng)激不改變CRH mRNA水平,阻斷急性應(yīng)激所誘導(dǎo)的CRH mRNA水平增高的效應(yīng)。慢性應(yīng)激時(shí),CRH神經(jīng)元胞體增大,接受谷氨酸能及去甲腎上腺素能傳入神經(jīng)纖維增多,CRH 釋放增加。
RNAi技術(shù)是一種通過觸發(fā)同源RNA 降解使目的基因沉默的技術(shù),由于具有特異性、高效性、多能性而被廣泛應(yīng)用。RNAi技術(shù)可以利用siRNA或siRNA表達(dá)載體快速、經(jīng)濟(jì)、簡(jiǎn)便的以序列特異方式剔除目的基因表達(dá),所以現(xiàn)在已經(jīng)成為探索基因功能的重要研究手段。同時(shí)嵌入慢病毒載體技術(shù),使目的基因整合到宿主的DNA序列,慢病毒介導(dǎo)的基因表達(dá)或RNAi干擾作用持續(xù)且穩(wěn)定。與其他病毒載體相比,擴(kuò)大了載體感染細(xì)胞的范圍,適用于體內(nèi)基因治療,為研究基因功能提供了更強(qiáng)有力的工具。本實(shí)驗(yàn)在確定CRH 基因存在于PVN的前提下,用Oligoengine軟件,設(shè)計(jì)出GC含量在45%-55%的4個(gè)shRNA 序列及一個(gè)陰性對(duì)照序列,連接慢病毒載體GV118,測(cè)序鑒定后,將構(gòu)建重組的載體和慢病毒包裝質(zhì)粒共同轉(zhuǎn)染293T細(xì)胞,然后通過實(shí)時(shí)PCR靶點(diǎn)篩選出有效的干擾序列。經(jīng)Western blot和實(shí)時(shí)PCR的鑒定成功構(gòu)建了CRH 的RNAi慢病毒載體,293T細(xì)胞包裝后產(chǎn)生了高滴度的病毒顆粒。本實(shí)驗(yàn)為研究PVN 內(nèi)CRH神經(jīng)元敏感化在應(yīng)激反應(yīng)中的作用及進(jìn)一步研究CRH 基因功能打下了基礎(chǔ)。
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