芬蘭實(shí)習(xí)的總結(jié)
今年6月有幸被愛因斯特(中國(guó))組織選中,于7月8日至8月31日在芬蘭Helsinki的Helsinki University of Technology中的Laboratory of Computational Engineering進(jìn)行了為期3個(gè)月的實(shí)習(xí)培訓(xùn)。 生活 在我剛到芬蘭的頭幾天,對(duì)我來(lái)說(shuō)一切都是陌生而新鮮的,所幸得到了實(shí)驗(yàn)室秘書eeva lampinen女士以及同在實(shí)驗(yàn)室的中國(guó)留學(xué)生趙偉的無(wú)微不至的幫助。使我能在最短的時(shí)間內(nèi),適應(yīng)這個(gè)陌生的環(huán)境,并盡早的投入工作。
很幸運(yùn),在芬蘭的日子中,都遇到了一些中國(guó)人,雖然大家都很忙,平時(shí)也就是在路上匆匆點(diǎn)頭致意。但是當(dāng)你遇到需要幫助的時(shí)候,他們都能給予力所能及的幫助。這里的中國(guó)人有一個(gè)郵件列表,有千余名的中國(guó)人與當(dāng)?shù)厝税炎约旱泥]箱加到上面去,大家可以在這里交流一些供求信息、發(fā)布看法與提供幫助,功能類似于這里的bbs。另外我在生活中還結(jié)識(shí)了一些朋友,因?yàn)樗麄兊哪挲g都比我大得多,而且在國(guó)外學(xué)習(xí)了許多年,因此他們對(duì)于很多事情的看法都和我所了解的不一樣。這樣的交流是一件很奇妙的事情。 在我的夏天過(guò)去接近一半的時(shí)候,來(lái)了兩個(gè)人和我合住公寓,一個(gè)意大利人,一個(gè)德國(guó)人。于是原本平靜而有些單調(diào)的生活變得豐富多彩起來(lái),每晚都和他們喝啤酒聊天聊上許久,聊歐洲與中國(guó)的不同、自己的研究方向、個(gè)人的生活,文化的差異在這里成了一件興趣盎然的事情。而喝啤酒是一件如此平常的事情,以至于為數(shù)不多的幾個(gè)我所知道的德語(yǔ)與意大利語(yǔ)都是和敬酒或者酒的用具有關(guān)。 他們比我要能更快的適應(yīng)那里的環(huán)境,沒(méi)三天已經(jīng)安之若素了。在溝通方面,他們也比我要更快的,雖然其他的伙伴對(duì)我也很禮貌,但是就是缺乏那么多的共通點(diǎn)。我覺得這樣子的交流機(jī)會(huì)的確是非常有價(jià)值而且重要的。
工作 本來(lái)實(shí)驗(yàn)室中具體負(fù)責(zé)在這個(gè)夏天指導(dǎo)我的那個(gè)導(dǎo)師mikko karttunen先生,是給了我安排了一個(gè)計(jì)劃,但是通過(guò)之前的聯(lián)系, 他對(duì)我的本科畢業(yè)設(shè)計(jì)的工作有了了解,對(duì)我的這個(gè)工作的產(chǎn)生了一些興趣,這個(gè)工作是利用計(jì)算物理學(xué)中的monte carlo simulation,以及cellular automata等一些方法來(lái)模擬帕金森氏癥中alpha—synuclein蛋白質(zhì)的積聚現(xiàn)象。 因此在開始的一段時(shí)間,我為此準(zhǔn)備了一個(gè)幻燈片以及一個(gè)報(bào)告。可能是這個(gè)課題比較新穎,而且能夠?qū)⑽锢韺W(xué)與分子生物學(xué)這兩大領(lǐng)域結(jié)合起來(lái),于是這個(gè)報(bào)告獲得了相當(dāng)大的關(guān)注,實(shí)驗(yàn)室的幾個(gè)沒(méi)有休假的教授以及大部分的研究生都參加了我的報(bào)告。后來(lái)經(jīng)過(guò)我的詳細(xì)介紹以及多次的討論他們也開始對(duì)這個(gè)方向發(fā)生了興趣。覺得還是讓我在那里繼續(xù)這個(gè)課題的工作,karttunen先生委托了他的一個(gè)博士后michael patro先生具體在這個(gè)領(lǐng)域和我合作,提供具體的指導(dǎo)與幫助。他自己也會(huì)經(jīng)常的和我就工作的進(jìn)展和發(fā)生的問(wèn)題進(jìn)行討論。
Michael patro先生對(duì)我的工作的幫助是巨大的,因?yàn)樵诒究齐A段我比較關(guān)注的是程序中所對(duì)應(yīng)的具體的物理過(guò)程,對(duì)于運(yùn)行結(jié)果的`精確性以及程序的運(yùn)行速度考慮得并不多,在他的幫助下,我?guī)缀跤职颜麄(gè)程序的源代碼重新寫了一遍,得到了于實(shí)際情況更加符合的結(jié)果。并且我們接下去討論了如何在這個(gè)程序的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步將蛋白質(zhì)突變對(duì)整個(gè)過(guò)程所產(chǎn)生的影響,作為一個(gè)控制因素納入程序的考慮范圍,這樣的話就可以和我們?cè)谏虾5暮献髡哌M(jìn)行對(duì)alpha—synuclein蛋白進(jìn)行突變,所獲得的試驗(yàn)結(jié)果加以比較。進(jìn)一步揭示這個(gè)疾病的分子機(jī)理。由于已經(jīng)確定了進(jìn)一步的合作關(guān)系,Mikko karttunen先生對(duì)于生化試驗(yàn)的數(shù)據(jù)提出了非常詳盡的要求,于是在回國(guó)的這段時(shí)間,我已經(jīng)到過(guò)上海的合作者那里,進(jìn)行了實(shí)地的考察,了解那里的試驗(yàn)設(shè)備,得到了滿意的結(jié)果。這樣我就可以進(jìn)一步的在這個(gè)領(lǐng)域和他們進(jìn)行合作,這是非常難得的一個(gè)機(jī)會(huì)。
這個(gè)課題,在本科階段,基本上就是我一個(gè)人獨(dú)立完成的。從確立題目,到寫程序。但是他們并不以為不重要,相反的非常尊重我的選擇,并的確通過(guò)這接近兩個(gè)月的工作,初步得到了滿意的結(jié)果。這個(gè)情況,在國(guó)內(nèi)是很難加以想象的。
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